Organická chemie je jednou ze základních chemických disciplín a předmětem jejího zkoumání jsou jak přírodní, tak uměle připravené sloučeniny, tvořené vždy jedním nebo více atomy uhlíku a dalších prvků, jako například vodíku, kyslíku, dusíku, síry atd. Organická chemie se dále zabývá chemickou stukturou těchto molekul, jejich reakcemi a reakčními mechanismy. Skripta Chemie pro biology II navíc zohledňují další kritéria, jako je výskyt konkrétních látek v přírodě, jejich vzájemné vztahy a zejména vztah těchto látek k regulaci a vývoji rostlinných a živočišných systémů, jejich biologické funkce a metabolismus. Tato skripta se tedy snaží popsat základní chemické procesy, které jsou spojeny s diskutovanými skupinami organických látek v přímé souvislosti s jejich výskytem v přírodě.