Hlavním cílem druhého vydání komentáře je tak jako u prvého vydání především co možná nejpodrobněji vysvětlit obsah, účel a smysl jednotlivých ustanovení zákona, a to jak s přihlédnutím k jejich teoretickým východiskům, tak s přihlédnutím k požadavkům plynoucím z praktické aplikace tohoto kodexu, které by měly být uspokojeny zejména odkazy na promítnutí jednotlivých institutů správního řádu do (některých) zvláštních zákonů. Komentář obsahuje rovněž vnitřní odkazy potřebné k orientaci v systematice celého předpisu a upozorňuje na vzájemné vazby a souvislosti jednotlivých ustanovení obsažených v tomto zákoně. Praktické využití komentáře by mělo být usnadněno rovněž řadou citací z judikatury správních soudů, a to v rozsahu, v jakém je využitelná při aplikaci nového zákona, váže-li se stále ještě především k předchozí právní úpravě. Oproti prvnímu vydání komentáře je nyní možné vycházet rovněž z řady praktických zkušeností, které vyplynuly z aplikace zákona v prvním roce a půl jeho účinnosti a které autor komentáře získává ze svého působení v několika rozkladových komisích (Ministerstvo pro místní rozvoj, Ministerstvo životního prostředí, Ministerstvo vnitra), v poradním sboru ministra vnitra pro správní řád a v neposlední řadě také z bezprostředních kontaktů s těmi, kdo správní řád ve své každodenní praxi aplikují na různých stupních veřejné správy. Druhé vydání komentáře je rovněž obohaceno (v rozsahu, v jakém to komentář k obecnému procesnímu předpisu dovoluje) odkazy na vybrané instituty nového stavebního zákona jako první rozsáhlé normy kodexového typu v oblasti správního práva, která byla přijata po vydání nového správního řádu a jež byla připravována v úzké návaznosti na něj, zejména pokud jde o úpravu opatření obecné povahy nebo veřejnoprávních smluv.